公司罚款可以申请劳动仲裁。若劳动者认为公司的罚款行为侵犯了自身合法权益，就有权通过劳动仲裁来维护权益。
从专业角度来看，根据《中华人民共和国劳动法》《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，用人单位应当依法建立和完善规章制度，保障劳动者享有劳动权利和履行劳动义务。但是，用人单位并没有对劳动者进行罚款的法定权力。企业罚款实际上是一种经济处罚措施，只有在法律明确授权的情况下才可以实施，而目前我国法律并未赋予企业普遍的罚款权。如果公司以罚款的方式克扣劳动者工资，这种行为属于违法行为。劳动者的工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。当公司的罚款行为损害了劳动者的工资权益时，劳动者就可以通过劳动仲裁来解决纠纷。
举例说明：
小张是一家公司的员工，公司规定员工迟到一次罚款50元。有一次小张因为突发交通拥堵迟到了，公司便从他当月工资中扣除了50元。小张认为自己迟到并非主观故意，且公司的罚款规定不合理。这种情况下，小张可以先与公司进行沟通协商，要求公司返还扣除的罚款。如果公司拒绝，小张就可以收集相关证据，如工资条、考勤记录、公司的罚款通知等，向劳动仲裁机构申请仲裁，要求公司退还罚款并保障自己的合法权益。
法律解析：
在法律层面，《工资支付暂行规定》明确规定，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。也就是说，即使用人单位因员工过错要求赔偿损失，也必须遵循法定的扣除方式和比例。而公司随意设定罚款规则，没有法律依据，属于侵犯劳动者工资报酬权的行为，劳动仲裁机构会依据相关法律规定，判断公司罚款行为是否合法，若不合法，会支持劳动者的合理诉求。
注意事项：
1. 及时收集证据，如工资条、考勤记录、公司的罚款通知、与公司沟通的聊天记录等，这些证据对于证明公司的罚款行为和自身权益受损情况至关重要。
2. 了解劳动仲裁的申请时效，一般情况下，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
3. 准确填写劳动仲裁申请书，明确自己的仲裁请求，如要求公司返还罚款的具体金额、支付相应的经济补偿等。
4. 在与公司沟通协商时，注意保留好相关的沟通记录，避免情绪化交流，尽量以理性的方式表达自己的诉求。
5. 若对劳动仲裁的流程和法律规定不太熟悉，可以咨询专业的律师，获取更准确的法律建议和指导。
总之，当劳动者遇到公司不合理罚款的情况时，有权通过劳动仲裁来维护自己的合法权益。但在整个过程中，要注意遵循法律程序和相关规定，以确保自己的诉求能够得到合理解决。以上内容仅供参考，法律咨询具有特殊性，如遇到法律问题建议本站免费在线问律师，获取专业律师的解答。
