劳动合同主体变更不一定合法，需要看具体情况，符合法定情形且遵循法定程序的变更就是合法的。
从专业角度来看，劳动合同主体变更通常涉及用人单位主体变更和劳动者主体变更。对于用人单位主体变更，根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十三条规定，用人单位变更名称、法定代表人、主要负责人或者投资人等事项，不影响劳动合同的履行。这意味着这类形式上的变更，原劳动合同继续有效，主体变更合法。而第三十四条规定，用人单位发生合并或者分立等情况，原劳动合同继续有效，劳动合同由承继其权利和义务的用人单位继续履行。这种情况下，劳动合同主体在实质上发生了变化，但也是合法的。
当涉及劳动者主体变更时，一般需要用人单位、原劳动者和新劳动者三方协商一致，并且签订相关的协议来明确各方的权利和义务。如果没有经过这样的法定程序，擅自变更劳动合同主体就是不合法的。
举例说明：
小王在A公司工作，后来A公司被B公司合并。此时，小王与A公司签订的劳动合同依然有效，B公司作为承继A公司权利和义务的用人单位，继续履行与小王的劳动合同，这种主体变更就是合法的。又比如，小李原本在C公司工作，C公司想将小李的劳动关系转移到关联公司D公司。如果C公司、小李和D公司三方协商一致，签订了相关的协议，明确小李与C公司解除劳动合同，同时与D公司签订新的劳动合同，那么这种劳动者主体的变更也是合法的。但如果C公司没有和小李协商，直接将小李的劳动关系转移到D公司，这就是不合法的。
法律解析：
法律之所以这样规定，是为了保护劳动者的合法权益，维护劳动关系的稳定。对于用人单位主体的变更，只要权利义务能够得到承继，原劳动合同继续履行，劳动者的权益就不会受到损害。而对于劳动者主体变更要求三方协商一致，是因为劳动合同是双方基于自愿、平等、协商一致的原则签订的，变更主体涉及到劳动者的切身利益，必须经过劳动者的同意，以保障劳动者的选择权和合法权益。
注意事项：
1. 用人单位主体变更时，要及时向劳动者说明情况，确保劳动者了解变更的内容和影响。
2. 涉及劳动者主体变更时，必须与劳动者充分协商，取得劳动者的书面同意。
3. 无论是哪种主体变更，都要签订相关的书面协议，明确各方的权利和义务，避免后续产生纠纷。
4. 变更过程中要遵循法定程序，按照法律规定处理劳动关系的转移和衔接。
5. 用人单位要妥善处理好变更前后的工资、社保等相关事宜，保障劳动者的权益不受侵害。
综上所述，劳动合同主体变更在符合法定情形和程序时是合法的。在实际操作中，用人单位和劳动者都要严格按照法律规定行事，以维护自身的合法权益。以上内容仅供参考，法律咨询具有特殊性，如遇到法律问题建议本站免费在线问律师，获取专业律师的解答。
