根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。这里的“知道或者应当知道其权利被侵害之日”，对于加班工资而言，通常是劳动者知道用人单位未依法支付加班工资的时间点。
不过，存在特殊情况。如果劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受上述一年仲裁时效期间的限制。但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。加班工资属于劳动报酬的范畴，所以在劳动关系存续期间，劳动者主张加班工资不受一年仲裁时效的限制。一旦劳动关系终止，就需要在终止之日起一年内申请仲裁。
举例说明：
小李在一家公司工作，公司经常安排他加班，但一直没有支付加班工资。小李一直在这家公司工作，那么在他在职期间，随时都可以就加班工资问题申请劳动仲裁。假设小李工作了三年后离职了，离职时他才想起公司未支付加班工资，那么他就需要在离职之日起一年内申请仲裁，如果超过一年才申请，就可能面临仲裁时效已过，无法得到仲裁支持的风险。
法律解析：
法律设定仲裁时效制度，主要是为了督促当事人及时行使权利，维护社会经济秩序的稳定。对于加班工资仲裁时效的规定，既考虑到了劳动者在劳动关系中的相对弱势地位，给予其在劳动关系存续期间主张权利的便利，又通过在劳动关系终止后设定一年的时效，促使劳动者及时清理与用人单位之间的劳动争议，避免时间过长导致证据难以收集等问题。
注意事项：
1. 劳动者要留意自己的加班情况，保留好加班的相关证据，如加班通知、考勤记录等，以便在需要主张加班工资时能够证明自己的加班事实。
2. 如果在职期间发现用人单位未支付加班工资，可及时与用人单位沟通协商解决，协商不成的应尽快申请仲裁，不要拖延。
3. 一旦劳动关系终止，要牢记在一年内申请仲裁，避免因超过时效而丧失胜诉权。
4. 不同地区对于加班工资仲裁时效的具体适用和理解可能存在一定差异，在处理相关问题时，可向当地劳动仲裁机构或专业律师咨询。
以上内容仅供参考，法律咨询具有特殊性，如遇到法律问题建议通过正规渠道咨询专业律师，获取专业律师的解答。
